
淺談模式生物斑馬魚(yú)在遺傳性肌肉疾病研究中的應用
發(fā)布時(shí)間:
2022-04-21
摘要
隨著(zhù)分子遺傳學(xué)技術(shù)的進(jìn)步尤其是高通量測序技術(shù)的廣泛應用,遺傳性肌肉疾病致病基因的檢測得到了普及,但在變異位點(diǎn)致病性的判定以及疾病分子機制和干預藥物的研究方面仍面臨著(zhù)許多問(wèn)題和挑戰。國內肌病領(lǐng)域利用斑馬魚(yú)等模式生物開(kāi)展的研究尚有限,而斑馬魚(yú)肌肉發(fā)育相關(guān)的基因保守性高,遺傳操作方法豐富,運動(dòng)行為表型的評價(jià)也相對容易,可作為遺傳性肌肉疾病研究的有力工具。本文就斑馬魚(yú)作為遺傳性肌病模式生物的優(yōu)勢、具體應用及局限性進(jìn)行討論,以期能夠推動(dòng)相關(guān)研究,并使遺傳性肌肉疾病患者獲益。
目前國內遺傳性肌肉疾病致病基因的檢測逐漸得到普及,為此類(lèi)疾病的精準診斷提供了重要的技術(shù)支撐,但高通量測序發(fā)現了大量臨床意義未明的變異位點(diǎn),其致病性判定仍然面臨著(zhù)巨大挑戰,針對肌病領(lǐng)域的治療藥物和干預措施的研究也較為少見(jiàn)。斑馬魚(yú)自20世紀90年代作為模式生物引入我國后,在發(fā)育生物學(xué)、毒理學(xué)和遺傳學(xué)等領(lǐng)域得到了廣泛應用,但多被應用于造血、心血管等相關(guān)疾病。近年來(lái)斑馬魚(yú)遺傳操作技術(shù)不斷發(fā)展,斑馬魚(yú)作為遺傳性肌肉疾病的模型在變異位點(diǎn)致病性驗證和干預措施研發(fā)方面呈現出巨大潛力。本文就斑馬魚(yú)作為遺傳性肌病模式生物的優(yōu)勢、具體應用及局限性做一述評,以期為肌肉疾病領(lǐng)域的研究者提供新的思路。
一、斑馬魚(yú)作為模式生物應用的優(yōu)勢
斑馬魚(yú)作為模式生物的使用最早可追溯至20世紀60年代[1],最初被應用于脊椎動(dòng)物發(fā)育的研究。自20世紀80年代以來(lái),隨著(zhù)斑馬魚(yú)全基因組測序的完成與基因編輯操作技術(shù)的發(fā)展[2],斑馬魚(yú)作為模式生物被廣泛應用于研究基因功能、探討致病基因的作用機制、建立疾病模型用于治療藥物的篩選等。斑馬魚(yú)是重要的脊椎動(dòng)物模型,同時(shí)又具有無(wú)脊椎動(dòng)物的某些典型特征,填補了細胞培養和嚙齒動(dòng)物之間的空白。
(一)斑馬魚(yú)遺傳操作技術(shù)方法快捷
近年來(lái),斑馬魚(yú)模式生物主要是通過(guò)反向遺傳學(xué)原理進(jìn)行造模。采用斑馬魚(yú)胚胎顯微注射技術(shù)向1~4細胞期的胚胎中注射嗎啉環(huán)修飾的嗎啉代反義寡核苷酸(morpholino,MO),干擾mRNA前體剪切或翻譯,可以短暫抑制特定基因的表達,一般維持3 d左右。這種反義寡核苷酸技術(shù)主要應用于暫時(shí)性敲降在斑馬魚(yú)早期胚胎發(fā)育中有表達的目的基因,快速簡(jiǎn)便。而采用基因編輯技術(shù)則可產(chǎn)生穩定突變體的斑馬魚(yú),包括鋅指核酸酶(zinc finger nucleases)技術(shù)、轉錄激活因子樣效應物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases)技術(shù)以及CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)/Cas9(CRISPR-associated protein 9)技術(shù)。通過(guò)基因工程改造的核酸酶可以精確靶向誘導雙鏈 DNA 斷裂(double strand break),誘導生物體通過(guò)非同源末端連接(non-homologous end joining)或同源重組(homology-directed repair)方式進(jìn)行修復,從而實(shí)現定點(diǎn)敲除、插入、缺失或者堿基置換,以達到構建永久性基因敲入/敲除斑馬魚(yú)模型的目的。向斑馬魚(yú)早期胚胎注射DNA或RNA可實(shí)現外源基因短期過(guò)表達,而利用轉基因技術(shù)可構建穩定遺傳的插入品系,調控靶基因的持續表達,從而研究目的基因的生物學(xué)功能。
(二)斑馬魚(yú)肌肉表型分析可實(shí)現多元化和客觀(guān)量化
斑馬魚(yú)具有典型的運動(dòng)行為,易于觀(guān)察和評價(jià),肌肉發(fā)育迅速,在受精后17 h開(kāi)始自發(fā)收縮。到了受精后24 h,肌節開(kāi)始出現,胚胎能夠卷曲甚至對觸碰作出反應。受精后48 h肌肉分化完全,幼魚(yú)在受精后96 h可自由游動(dòng)[3]。利用胚胎自發(fā)卷繞和觸碰誘發(fā)的幼魚(yú)逃避反應,可以簡(jiǎn)單直接地評估斑馬魚(yú)肌病模型的運動(dòng)功能[4]。也可通過(guò)視頻記錄一定時(shí)間內斑馬魚(yú)的游動(dòng)軌跡,分析其運動(dòng)距離和運動(dòng)時(shí)間,以比較運動(dòng)能力的改變。
斑馬魚(yú)有較為完整的評價(jià)體系來(lái)評估其肌肉結構。骨骼肌在斑馬魚(yú)軀干中占相當大的比例,其肌節的超微結構和收縮特性均與人類(lèi)肌肉有著(zhù)極高的相似性[5]。斑馬魚(yú)骨骼肌高度有序的肌節形狀在偏振光下顯得明亮,其雙折射特性使肌肉結構損傷的定量評估成為可能。研究人員可以通過(guò)雙折射分析在活體或固定標本上快速、無(wú)創(chuàng )地評估肌肉結構的破壞情況[6]。斑馬魚(yú)的胚胎透明特性有利于肌肉發(fā)育的監測,利用轉基因技術(shù)可以將外源熒光蛋白基因單獨或作為融合蛋白的一部分導入斑馬魚(yú)胚胎,目前已有較為成熟的標記斑馬魚(yú)肌肉結構的轉基因斑馬魚(yú)系如Tg2(smyhc1:EGFP)[7]。也可利用免疫組織化學(xué)、免疫熒光技術(shù)進(jìn)行斑馬魚(yú)肌病模型中肌纖維和肌節結構缺陷的觀(guān)察。
二、斑馬魚(yú)作為模式生物在遺傳性肌肉疾病研究中的應用
遺傳性肌病新的致病基因及眾多意義未明的變異位點(diǎn)的致病性都亟需動(dòng)物模型驗證,同時(shí),此類(lèi)疾病治療手段的匱乏也要求強大的篩選平臺以支持干預措施的研究。鑒于以上斑馬魚(yú)作為模式生物的顯著(zhù)優(yōu)勢,如能推動(dòng)斑馬魚(yú)在遺傳性肌肉疾病領(lǐng)域的應用,可以更好地應對基因檢測技術(shù)普及帶來(lái)的機遇與挑戰,促進(jìn)遺傳性肌肉疾病致病機制的研究及潛在藥物的發(fā)現。下面簡(jiǎn)述斑馬魚(yú)作為肌肉疾病模式生物代表性的研究應用,以啟發(fā)科研工作者開(kāi)拓視野,促進(jìn)研究領(lǐng)域學(xué)術(shù)發(fā)展。
(一)遺傳性肌肉疾病致病基因的驗證
遺傳性肌肉疾病多具有顯著(zhù)的遺傳異質(zhì)性,尤其是肌營(yíng)養不良、先天性肌病等[8],這些疾病的癥狀往往相互重疊,僅通過(guò)臨床表型無(wú)法準確判斷疾病的亞型,因此需要借助分子遺傳學(xué)手段進(jìn)行精準診斷,并以此為基礎開(kāi)展遺傳咨詢(xún)和產(chǎn)前診斷。另外,隨著(zhù)基因檢測成本的降低,研究者發(fā)現了大量臨床意義未明的變異,持續不斷地擴大著(zhù)肌病相關(guān)的基因突變譜系。然而,未報道過(guò)的新基因或變異位點(diǎn)需慎重判斷其致病性,有效的動(dòng)物模型往往能提供可靠的證據。
斑馬魚(yú)骨骼肌生長(cháng)和發(fā)育過(guò)程高度保守,80%以上與人類(lèi)肌肉疾病有關(guān)的基因都可以在斑馬魚(yú)基因組中找到同源基因,包括編碼抗肌萎縮蛋白-糖蛋白復合物、興奮-收縮耦聯(lián)組分等基因[9, 10, 11],這意味著(zhù)斑馬魚(yú)非常適合作為構建遺傳性肌肉疾病的模型。另一方面,相較于國內常用的小鼠模型,斑馬魚(yú)體外受精易于對胚胎進(jìn)行遺傳學(xué)操作,降低了建模難度。另外,一對健康成年斑馬魚(yú)一次交配可產(chǎn)卵200枚以上,產(chǎn)卵間隔僅1周,且發(fā)育迅速,極大地縮短了模型構建周期。
(二)遺傳性肌肉疾病致病機制的研究
相對于細胞和組織層面,利用斑馬魚(yú)來(lái)研究疾病的分子機制是在體內模型的層面,更容易得出讓人信服的結論,可在一定程度上替代體外模型。借助整胚原位雜交技術(shù)、免疫熒光技術(shù)等,能在胚胎組織或細胞結構不被破壞的條件下,從整體上把握肌病背景下相關(guān)分子mRNA及蛋白水平的改變。熒光探針技術(shù)可實(shí)現在斑馬魚(yú)活體水平標記疾病相關(guān)靶點(diǎn),并可在病理狀態(tài)下觀(guān)察其動(dòng)態(tài)改變。
此外,斑馬魚(yú)信號傳導通路與人類(lèi)近似,氧化應激水平增加與RyR1相關(guān)肌病、自噬功能受損與肌原纖維肌病等都得到了斑馬魚(yú)模型證據的支持。ryr突變幼魚(yú)細胞應激相關(guān)的部分通路發(fā)生了顯著(zhù)改變,特別是氧化應激標記基因表達的增加[12]。Bag3缺乏的斑馬魚(yú)肌肉電鏡下可觀(guān)察到自噬囊泡結構異常,誘導自噬流后免疫印跡顯示自噬標志物微管相關(guān)蛋白1輕鏈3-Ⅱ積聚減少,表明其自噬活性受損[13]。
(三)遺傳性肌肉疾病治療靶點(diǎn)的篩選
結合高通量測序及肌肉病理分析,遺傳性肌病大多數已經(jīng)可以得到精準診斷,但絕大部分遺傳性肌病仍然缺乏有效的干預手段,相當一部分患者并未因精準診斷而獲益,因此遺傳性肌病未來(lái)研究的重點(diǎn)應該放在新型藥物研發(fā)和基因治療等領(lǐng)域。斑馬魚(yú)模型既可以像體外實(shí)驗那樣對作用靶點(diǎn)明確的候選化合物進(jìn)行靶向篩選,也可以像哺乳動(dòng)物一樣對靶點(diǎn)不明或致病機制不明的疾病進(jìn)行基于藥效學(xué)的干預藥物篩選和評價(jià),能夠提高藥物早期藥效學(xué)評價(jià)的靈敏性和可靠性,還可以進(jìn)行基因編輯治療的探索。如果能將斑馬魚(yú)模型和哺乳動(dòng)物模型相結合,可以從整體上縮短干預藥物或措施的研發(fā)實(shí)驗周期,降低成本和風(fēng)險,提高研發(fā)效率。
與嚙齒類(lèi)動(dòng)物相比,斑馬魚(yú)易飼養、體積小,其胚胎可以在96孔或384孔板中培養。而且在培養皿中的斑馬魚(yú)胚胎可以直接吸收添加至培養液中的藥物,適合進(jìn)行中到高通量的藥物篩選的初步研究?;诎唏R魚(yú)的迪謝內肌營(yíng)養不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)模型已篩選了超過(guò)4 500種小分子化合物[14],發(fā)現了至少25種有效藥物,如非選擇性磷酸二酯酶抑制劑氨茶堿[15]、選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑氟西汀[16]、靶向血紅素加氧酶信號通路的西地那非[17]等。除上述靶向參與DMD發(fā)病機制相關(guān)途徑來(lái)改善肌肉功能和質(zhì)量,斑馬魚(yú)模型也適用于評價(jià)基因組編輯療法、基因產(chǎn)物修飾如外顯子跳躍和終止密碼子通讀等基因治療策略。有研究者向dystrophin基因無(wú)義突變的斑馬魚(yú)胚胎中注射影響轉錄物剪接的MO,將攜帶突變的外顯子從成熟的mRNA中去除,恢復了部分dystrophin蛋白的功能,斑馬魚(yú)肌節結構顯著(zhù)改善,從而證實(shí)了外顯子跳躍治療策略的可行性[18]。
三、斑馬魚(yú)模型應用的局限性
首先,斑馬魚(yú)組織解剖結構與人類(lèi)的相似性不如小鼠,如哺乳動(dòng)物快肌與慢肌相間分布,而斑馬魚(yú)快肌與慢肌在位置上完全分離。其次,針對斑馬魚(yú)的抗體種類(lèi)較少,定制斑馬魚(yú)抗體耗時(shí)且成本較高,一定程度上限制了分子機制的研究。此外,浸泡給藥方式無(wú)法準確控制藥物攝取量,斑馬魚(yú)的藥物代謝系統與人類(lèi)有一定差異,給藥物臨床轉化帶來(lái)困難。另外,斑馬魚(yú)肌肉疾病模型的質(zhì)量控制尤為重要,不能僅以斑馬魚(yú)形態(tài)和運動(dòng)功能等非特異性改變?yōu)樵u價(jià)標準,必須有如桿狀體、中央核或軸空等病理組織化學(xué)特征以及dystrophin蛋白的表達缺失等分子病理特征支持[19, 20],以產(chǎn)生符合人類(lèi)疾病特征又可擴展用于高通量藥物篩選的可靠疾病模型。
四、展望
由于斑馬魚(yú)模型在遺傳和胚胎操作以及肌肉結構和功能評價(jià)方面的優(yōu)勢,近年來(lái)備受研究人員青睞,在國際上已被廣泛應用于肌肉疾病發(fā)病機制的研究和治療開(kāi)發(fā),且已取得了一系列令人振奮的研究成果。展望未來(lái),生命與健康領(lǐng)域中最富創(chuàng )造力的將是新藥研發(fā),斑馬魚(yú)模型憑借體外細胞培養和其他模式動(dòng)物不可替代的獨特優(yōu)勢,將成為大規?;瘜W(xué)藥物篩選和探索基因治療的強大工具,也必將為人類(lèi)逐漸征服遺傳性肌肉疾病發(fā)揮重要作用。